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Problema

Es tremendamente molesto e incómodo no tener los iconos en un escritorio, por que éstos son atajos a las aplicaciones que queremos arrancar pronto, aumentando nuestra productividad y eliminando la pérdida de tiempo buscando aplicaciones, pero con Unity y Gnome ya no aparecen en el escritorio ¿Donde están? ¿No van a volver?

Por culpa de esa molestia, muchos usuarios han decido cambiar a KDE pero para aquellos que todavía sigan prefiriendo Unity o Gnome, mejor lean este artículo.

He visto más de un equipo con Ubuntu en el que parecían desaparecer los iconos del escritorio, realmente no se borran, porque si nos dirigimos al directorio /home/usuario/Escritorio/ aparecen todos los archivos.

Solución

La solución pasa por instalar el paquete gnome-tweak-tool, abrimos un terminal

Ejecutamos el programa desde el terminal:

Nos abrirá una aplicación con la que podemos configurar varios aspectos de Gnome, activamos la opción Escritorio: Have file manager handle the desktop.

Si existen varios usuarios en el equipo deberán de ejecutar cada uno de ellos, en su sesión, el programa y activarlo.

Fuente:

https://codigo82.wordpress.com/2013/03/08/linux-desaparecen-los-iconos-del-escritorio/